پیش از تاریخی-
پژوهش های میدانی در حوزه باستان شناسی پیش از تاریخ ایران
پژوهش های تئوری در حوزه باستان شناسی پیش از تاریخ (مباحث اقتصادی، سیاسی، اجتماعی، اعتقادی، و غیره)
انسان شناسی و پژوهش های پیش از تاریخ ایران
برهم کنش های منطقه ای و فرامنطقه ای در حوزه پیش از تاریخ ایران
چشم انداز باستان شناسی پیش از تاریخ ایران (گذشته، حال و آینده)
پیش از تاریخ ایران و تطور فرهنگ مادی
پژوهش های باستان شناسی دوره پیش از تاریخ شرق ایران و خراسان جنوبی
تاریخی-
پژوهش های میدانی در حوزه باستان شناسی تاریخی ایران
پژوهش های تئوری در حوزه باستان شناسی تاریخی (مباحث اقتصادی، سیاسی، اجتماعی، اعتقادی، فرهنگی و غیره)
باستان شناسی تاریخی و منابع مکتوب
برهم کنش های منطقه ای و فرامنطقه ای در حوزه باستان شناسی تاریخی ایران
چشم انداز باستان شناسی تاریخی ایران (گذشته، حال و آینده)
باستان شناسی تاریخی و زبان های باستانی
پژوهش های باستان شناسی دوره تاریخی شرق ایران و خراسان جنوبی
اسلامی-
پژوهش های میدانی در حوزه باستان شناسی اسلامی ایران
پژوهش های تئوری در حوزه باستان شناسی اسلامی (مباحث اقتصادی، سیاسی، اجتماعی، اعتقادی، و غیره)
باستان شناسی اسلامی و منابع مکتوب
برهم کنش های منطقه ای و فرامنطقه ای در حوزه باستان شناسی اسلامی
چشم انداز باستان شناسی اسلامی ایران (گذشته، حال و آینده)
باستان شناسی اسلامی و زبان شناسی
پژوهش های باستان شناسی دوره اسلامی شرق ایران و خراسان جنوبی
میان رشته ای-
باستان شناسی و تعامل آن با علوم وابسته
پژوهشهای تحلیلی-آزمایشگاهی در باستان شناسی
باستان شناسی و هنر
باستان شناسی و گردشگری
باستان شناسی، معماری، مرمت و حفظ آثار
باستان مردم شناسی
باستان شناسی و علوم محیطی-جغرافیایی (سنجش از دور، باستان زمین شناسی، باستان شناسی منظر، دیرین اقلیم شناسی، باستان زیست بوم شناسی و غیره)
باستان شناسی و آموزش مردمی-عمومی